毛囊移植手术主要包括毛囊拔除法（FUE）以及取头皮（FUT）的方式。这两种手术各有优缺点，也各有其适合的状况，两者不能偏废，但两者都是相当耗费人力的手术。
自体毛囊移植手术的成功要素：
1.首先是选择
FUT的手术方式较为人担心的是取完头皮后缝合伤口产生的疤痕，以及术后的不适感，相对的FUE的术后伤口就好很多，可说几乎完全无痕，所以目前想采用FUE的方式的人相对较多。
对于FUE手术，其主要的缺点与限制在于所取毛发的数量，主要是因为FUE取毛囊时，是采取头枕部头皮的部位，是用趴着的姿势，长时间下来其实是不舒适的，也因此有时间上的限制，通常维持趴着的姿势很不容易能超过两个半小时，在这样有限的时间里，以个人目前的速度，能取出的毛发数约为1200-1500株，再加上植发的时间整个手术约需要5-6小时完成，所以FUE对于一次性超大数量的移植，是有困难的，特别是超过1500单位，可能就必须采用FUT的方式，或者改为两阶段FUE的方法。
2.手术方式
以拔取毛囊方式取发有效缩短手术时间，如果不愿意分阶段又在意术后头皮疤痕的长度，也可采用混搭的方式（FUE+FUT）。如此可以免除一条横贯头皮的手术疤痕，当然伤口在整形外科的仔细缝合之下，伤口不会太差，但如果所取头发量多且所取的头皮相当宽的情形下，要缝合的伤口张力强，有时疤痕外观就不是那么尽如人意了。混搭的方式不尽可以达到一阶段手术的目的，也可以缩短大家较在意的头皮伤口长度，又可缩短一些趴着不舒适的取发时间，也不失为一个好方法。
至于怎样提升满意度与毛发存活率，除了手术的仔细程度，种植的毛发数量一定要足够，术前术后可考虑使用口服或外用的生发药物，另外术后头皮的清洁，以及维持正常的生活作息与充足均衡的饮食，避免抽烟等等，都有助于存活率的提升以及避免再落发的情况。